Rumah Sakit H.A. Zaky Djunaid Kota Pekalongan merupakan fasilitas pelayanan kesehatan masyarakat di bawah naungan Yayasan H.A. Djunaid, yang berawal dari fasilitas kesehatan Klinik H.A. Djunaid yang diresmikan pada tanggal 16 September 2008.Seiring berjalan perkembangan pada tanggal 1 januari 2011 berganti dan peresmian Fasilitas Kesehatan Rumah Sakit H.A. Djunaid dengan type D.Pada tanggal 10 Februari 2017 mengalami perkembangan yang sangat pesat di dalam pelayanan kesehatan masyarakat dan mengalami perubahan nama menjadi RS. H.A. Zaky Djunaid.