RSIA Rachmi Yogyakarta terletak di Jalan Wachid Hasyim Nomor 47 Yogyakarta yang merupakan jalan utama di kota Yogyakarta. Letak Rumah Sakit di kota Yogyakarta bagian Barat yang berdekatan dengan wilayah perbatasan kabupaten Bantul begitu juga selatan berbatasan dengan wilayah kabupaten Bantul.
Lokasi yang berada di jalan utama merupakan tempat strategis untuk dapat dilalui oleh semua jenis kendaraan dan akses yang mudah berdekatan dengan taman parkir Ngabean. Untuk RS yang satu tipe dengan RSKA Rachmi, jaraknya masih cukup jauh, sehingga RSIA Rachmi memiliki posisi yang sangai strategis. Selain itu jaraknya pun berdekatan dengan berbagai perumahan, instansi pendidikan, dan mempunyai akses yang mudah untuk mencapainya.