Rumah Sakit Umum Santa Maria Cilacap adalah perwujudan kelanjutan karya suster-suster Tarekat Putri Bunda Hati Kudus (PBHK) atau dalam bahasa latin disebut Filiae Dominae Nostrae a Sacro Corde (FDNSC) yang berpusat di Issoudun, Perancis.

Pada tanggal 27 Desember 1949 para suster PBHK dari Tegal berangkat menuju ke Cilacap untuk melanjutkan karya kerasulan yang telah ditinggalkan selama kurang lebih dua puluh tahun, setelah melalui perjalanan yang sulit karena situasi, akhirnya para suster tiba di Cilacap tanggal 29 Desember 1949. Pada tahun 1969 para Suster PBHK menanggapi kebutuhan masyarakat melalui karya kerasulan baru dibidang kesehatan dengan didirikan Balai Pengobatan Santo Yosep dan Rumah Bersalin Santa Maria di jalan Melati nomor 25 Cilacap.

Setelah melalui beberapa kali pembicaraan, pertimbangan, masukan dari masyarakat, dan belajar dari beberapa sumber, maka Dewan Pimpinan para suster PBHK memutuskan BP Santo Yusup dan RB Santa Maria Cilacap dikembangkan menjadi Rumah Sakit Umum Santa Maria yang beralamat di jalan Ahmad Yani nomor 38 Cilacap, hingga sekarang.