Sejarah Berdirinya Rumah Sakit Kabupaten Karimun dahulu hanya mempunyai Puskesmas Tanjung Balai. Seiring pemekaran kecamatan menjadi kabupaten hingga saat ini Karimun mempunyai 12 Puskesmas dan 1 RSUD sebagai pusat rujukan tingkat Kabupaten. Pada kepemimpinan Bupati Karimun yang pertama yaitu H. Muhammad Sani, awal RSUD didirikan dengan nama Rumah Sakit Karimun dilakukan soft launching pada tanggal 22 April 2002 dengan Direktur pertamanya adalah dr. Zufri Taufiq. Setelah fase persiapan berakhir dilakukan grand opening pada tanggal 12 Oktober 2003 sejalan dengan HUT Kabupaten Karimun Ke-4 dengan Surat Izin Pelayanan Kesehatan Nomor 01/445/DK/IX/2003 dari Dinas Kesehatan Karimun. Pada Awal pembukaan RS Karimun mempunyai pelayanan 4 Spesialisasi dasar yaitu Spesialisasi Penyakit Dalam, Spesialisasi Kebidanan dan Kandungan, Spesialisasi Anak dan Spesialisasi Bedah, serta 2 pelayanan spesialisasi tambahan yaitu Spesialisasi Anestesi dan Radiologi. Selain itu Rumah Sakit Karimun juga mempunyai klinik umum dan klinik gigi. Pada tahun 2004 terjadi perubahan status Rumah Sakit Karimun dari BUMD menjadi RS milik Pemerintah Daerah dengan nama Rumah Sakit Umum Daerah Kabupaten Karimun melalui Peraturan Daerah Kabupaten Karimun Nomor 6 Tahun 2004 tentang SOTK RSUD Kab. Karimun.